大いに秘密主義的な匿名の開発者チームによって運営されている同プロジェクトは、未知の団体にハイジャックされた恐れがある。この利便性の高いデータ保護ユーティリティは、NSA の内部告発者 Edward Snowden や彼のジャーナリスト仲間のみならず、プライバシーを考慮する多くの人々から好まれている。
水曜日(編集部註:2014 年 5 月 28 日)以降、TrueCrypt のホームページは、同プロジェクト公式の SourceForge にホスティングされているページへと、訪問者をリダイレクトする。そこには「このソフトウェアは停止中だ」という趣旨のメッセージと――「ユーザーは別の選択肢を利用しなければならない」という趣旨のメッセージが表示されている。